Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms