Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms