Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms