Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms