Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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CHCHD4Q8N4Q1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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