Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms