Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms