Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms