Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms