Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RNF212Q495C1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms