Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms