Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME3Q16798 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME3Q16798 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ME3Q16798 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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