Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms