Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FXNQ16595 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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FXNQ16595 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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FXNQ16595 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FXNQ16595 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FXNQ16595 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FXNQ16595 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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