Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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