Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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