Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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