Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
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