Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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