Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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