Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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