Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF5Q13568 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms