Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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