Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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