Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms