Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms