Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms