Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms