Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms