Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms