Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms