Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms