Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFI35P80217 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFI35P80217 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFI35P80217 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFI35P80217 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IFI35P80217 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IFI35P80217 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IFI35P80217 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms