Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELNP78509 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELNP78509 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELNP78509 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELNP78509 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELNP78509 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RELNP78509 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELNP78509 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELNP78509 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms