Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX6P78412 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX6P78412 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX6P78412 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX6P78412 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX6P78412 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX6P78412 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX6P78412 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX6P78412 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX6P78412 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX6P78412 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX6P78412 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX6P78412 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX6P78412 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX6P78412 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms