Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK4P57078 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms