Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCR4P51679 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms