Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTBP49356 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTBP49356 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FNTBP49356 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FNTBP49356 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FNTBP49356 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FNTBP49356 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms