Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms