Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD34P28906 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD34P28906 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms