Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIFP27352 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIFP27352 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIFP27352 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIFP27352 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GIFP27352 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIFP27352 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIFP27352 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIFP27352 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIFP27352 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIFP27352 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms