Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RCC1P18754 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCC1P18754 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCC1P18754 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCC1P18754 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCC1P18754 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCC1P18754 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCC1P18754 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCC1P18754 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RCC1P18754 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCC1P18754 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCC1P18754 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms