Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LBPP18428 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LBPP18428 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LBPP18428 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LBPP18428 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LBPP18428 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LBPP18428 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms