Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms