Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms