Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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DEFA4P12838 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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DEFA4P12838 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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DEFA4P12838 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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DEFA4P12838 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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