Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms