Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYF2O95926 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms