Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms