Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCF2LO15068 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCF2LO15068 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms